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晶體日記(二十一)- 死而複生的晶體- X射線衍射XRD

更新時間:2024-09-11點擊次數:1575

知道我的人,發現近期我在提倡一個(ge) 字: 慢。對於(yu) 一個(ge) 急性子的人,有點不可思議。不過我提倡的“慢"不是指做事慢吞吞,而是留給自己足夠的時間去琢磨一些看起來簡單,無關(guan) 乎結果的事情。把節奏放慢下來。儀(yi) 器的進步帶來了很多便利,常見的一句話是現在的D8 VENTURE 真好用,好的晶體(ti) 分分鍾就測完了。挑晶體(ti) 的時間比測試的時間還長。確實現在的處境不是等機時,而是好多D8 VENTURE空在那裏等樣品。一個(ge) 星期長出來的樣品,一天就被清空了。剩下的時間做什麽(me) 呢?我覺得應該去琢磨哪些看起來不好做的晶體(ti) ,畢竟不好做的晶體(ti) 才真的有意思。
被判“無法拯救"的晶體(ti)

日前做過一個(ge) 很有趣的晶體(ti) 。樣品之前已經被學生判了無法拯救了。得到的信息是,晶體(ti) 很大,也很規整,但是衍射很差,幾乎沒有衍射點。

基於(yu) 這樣的描述,我們(men) 有可能的判斷是,這個(ge) 晶體(ti) 可能金玉其外敗絮其中,是個(ge) 中看不中用的晶體(ti) 。然而既然有時間了,我們(men) 為(wei) 什麽(me) 不能摸索摸索,看看這樣已經判了“無藥可救"的晶體(ti) ,能不能再搶救一下。

不過很快,事情很快發生了反轉。這個(ge) 晶體(ti) 並沒有那麽(me) 差,隻是很不穩定。使用偏光顯微鏡觀察能清楚的觀察到,晶體(ti) 在很短的時間內(nei) ,一點點的變化。由外到內(nei) ,由透亮的黃色,漸漸變成了綠色,然後慢慢變成了暗淡無光的墨綠色。死了一般的晶體(ti) ,衍射點彌散的很厲害。而墨綠色的晶體(ti) ,自然沒什麽(me) 衍射,意料之中的事。因為(wei) 晶體(ti) 死透了。

推測的原因是:晶體(ti) 的本質是有序的結構。當晶體(ti) 失去其內(nei) 部的溶劑時,這種有序的結構會(hui) 受到破壞。晶體(ti) 仿佛失去了生命,變得黯淡無光,這就是我們(men) 所說的“晶體(ti) 之死"。

然而趕在死亡之前去測試這顆晶體(ti) 確實有些挑戰,因為(wei) 留給你的搶救時間並不多。需要非常快的手速,非常銳利地眼光。然而即便如此,在測試了多個(ge) 晶體(ti) 之後,數據也隻限於(yu) 馬馬虎虎能看到些骨架。

如果這顆晶體(ti) 到這裏就結束了,就不能稱得上有趣了。

涅槃重生

死馬當活馬醫,測上晶體(ti) ,然後去吃了頓飯。然而對這個(ge) 晶體(ti) ,有些心有不甘。如果晶體(ti) 再穩定一些是不是數據會(hui) 好的很多。

於(yu) 是續集開始。在顯微鏡下,發現這些晶體(ti) 發生了奇怪的變化。原本已經黯淡無光死亡的晶體(ti) ,在顯微鏡下有了奇怪的變化。一些晶體(ti) 重新變的透亮,清澈。另一些則在兩(liang) 端開始變的透亮,雖然中間仍然黯淡無光,剩下的一些仍舊是死的。有些晶體(ti) 又活過來了?(而再過了一段時間,這些“死而複生"的晶體(ti) 的比例繼續變多)

那這些晶體(ti) 是不是真的複活了呢?D8 VENTURE很快給出來答案。不隻複活了,而且衍射質量明顯高出了很多,不管是衍射點的質量還是分辨率,都有明顯地提高。而且晶胞參數沒有發生太大的變化。這不是簡單的複活,這是涅槃重生了!

分析原因

推測的原因:

這些看似已經“死亡"的晶體(ti) ,在某種因素下重獲新生。原本在油裏失去溶劑死亡的晶體(ti) ,通過其他方式恢複了其內(nei) 部環境,比如吸水,吸油?原本散亂(luan) 的原子、分子或離子會(hui) 重新找到自己的位置,按照原本的規律重新排列。於(yu) 是晶體(ti) 複活了,並且重新的能量平衡,反而讓晶體(ti) 排列更規整了。

顯微鏡下觀察到的晶體(ti) 變化規律也能說明這點,由外到內(nei) 死亡,又由外到內(nei) 獲得重生。假若沒有在偏光顯微鏡下觀察;假若吃飯前已經放棄了這個(ge) 晶體(ti) ,扔掉了;假若吃飯回來沒有繼續觀察這個(ge) 晶體(ti) … 那麽(me) 也許故事就不一樣了。當然這個(ge) 結果也不應該就此結束。這種“死而複生"“涅槃重生"的現象,展示了它晶體(ti) 結構的靈活性和可恢複性。深入探討它的複活過程,以及不同的溶劑對結晶質量和穩定性的影響,會(hui) 得到更多更有趣的東(dong) 西。然而學生並不關(guan) 心….

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